Συγκεκριμένα, η εταιρεία δεν ήταν συνεπής με την υποχρέωσή της να καταβάλει τις εισφορές 1% και 3% επί των εισπράξεών της, σύμφωνα με το άρθρο 13 του ν. 2963/2001, όπως αυτός συμπληρώθηκε και τροποποιήθηκε με το ν. 4530/2018, για το χρονικό διάστημα από 01-12-2003 έως και 31-12-2012 και από 01-01-2014 έως και 31-12-2015.
Παράλληλα η εταιρεία εισέπραττε τις εισφορές από τους εξυπηρετούμενους επιβάτες μέσω των εισιτηρίων.